La missió de recerca del DSM s'estableix clarament a § 2 (3) subseccions 1-3 dels estatuts de la Fundació:
1."Recerca científica en tots els aspectes de la història de la navegació alemanya."
2."La col·lecció i conservació de material històric relacionat amb la navegació alemanya, com també la seva documentació i exposició."
3."La presentació pública d'assumptes relacionats amb la història marítima alemanya fent servir les instal·lacions tècniques, científiques i d'exposició disponibles a la Fundació."
4.
El museu compleix aquesta missió de recerca en la seva funció de museu nacional i membre de l'Associació Leibniz.
Els resultats de recerca del DSM es reflecteixen en les seccions individuals de les exposicions, com també periòdicament en les publicacions i exposicions especials. Qualsevol que s'hi interessi, ja sigui un científic o un neòfit, té l'oportunitat d'utilitzar els serveis del DSM, els quals ofereixen accés als recursos materials, documentals i pictòrics del museu.
El propòsit d'això és posar els resultats de la recerca a la disponibilitat d'un públic com més gran millor. És particularment important que el DSM, en una època de superabundància mediàtica, posi de relleu l'originalitat i independència del museu com a institució cultural mitjançant la presentació d'objectes i mòduls d'exposició autèntics i originals.
El museu també promou el desenvolupament de joves científics. Els estudiants poden fer-hi pràctiques o treballar en tots els nivells acadèmics, fins i tot en l'àmbit de recerca de doctorat.
Però ara ens hem de preguntar: "Què és exactament la navegació?"
Des d'un punt de vista socioeconòmic, la navegació no és tan sols l'economia marítima. També inclou l'explotació humana de l'entorn marí. Amb aquest rerefons, la història marítima no segueix una cronologia estricta. S'ha de veure des d'una perspectiva sociocientífica. En el camp científic, es defineix primàriament per l'objecte que s'investiga. Es pot veure com a subsecció de diverses disciplines -història econòmica, història tecnològica, ètica, etc. Com que la història marítima és una subsecció relativament nova de la història, no té ni tradició de recerca ni una metodologia analítica exhaustiva per a tots els seus aspectes.
La recerca al DSM es basa en la col·lecció sistemàtica de recursos sobre la història de la navegació alemanya. La col·lecció ha estat enregistrada digitalment amb l'ajuda del programari "MuseumPlus". El programari també és utilitzat per molts altres instituts importants. Gràcies a la revisió científica constant del catàleg de fonts materials, noves seccions de la col·lecció s'estan posant contínuament a l'abast de la recerca.

